MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodococcus erythropolis PR4 plasmid pREL1

Total Repeats: 6067

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007491	GCC	2	6	54	59	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2	NC_007491	CGC	2	6	76	81	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3	NC_007491	CGG	2	6	356	361	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	77454568
4	NC_007491	GCG	2	6	394	399	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	77454568
5	NC_007491	CGG	2	6	486	491	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	77454568
6	NC_007491	TCG	2	6	509	514	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	77454568
7	NC_007491	TG	3	6	516	521	0 %	50 %	50 %	0 %	77454568
8	NC_007491	AAC	2	6	524	529	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	77454568
9	NC_007491	CGTCA	2	10	541	550	20 %	20 %	20 %	40 %	77454568
10	NC_007491	GCA	3	9	557	565	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	77454568
11	NC_007491	CGGTAA	2	12	585	596	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	77454568
12	NC_007491	CGCT	2	8	658	665	0 %	25 %	25 %	50 %	77454568
13	NC_007491	GCC	2	6	716	721	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	77454568
14	NC_007491	GTT	2	6	791	796	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	77454568
15	NC_007491	TGC	2	6	829	834	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	77454568
16	NC_007491	GAG	2	6	1081	1086	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	77454568
17	NC_007491	TGA	3	9	1125	1133	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	77454568
18	NC_007491	ACA	2	6	1181	1186	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	77454568
19	NC_007491	AGG	2	6	1372	1377	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_007491	GCT	2	6	1409	1414	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	77454569
21	NC_007491	GCG	2	6	1564	1569	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	77454569
22	NC_007491	GCA	2	6	1681	1686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	77454569
23	NC_007491	CCT	2	6	1777	1782	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	77454570
24	NC_007491	CTTC	2	8	1816	1823	0 %	50 %	0 %	50 %	77454570
25	NC_007491	CTGT	2	8	1826	1833	0 %	50 %	25 %	25 %	77454570
26	NC_007491	GTCC	2	8	1862	1869	0 %	25 %	25 %	50 %	77454570
27	NC_007491	TTG	2	6	1908	1913	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	77454570
28	NC_007491	TTG	2	6	1986	1991	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	77454570
29	NC_007491	CCTGA	2	10	1993	2002	20 %	20 %	20 %	40 %	77454570
30	NC_007491	CTG	2	6	2009	2014	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	77454570
31	NC_007491	TTC	2	6	2024	2029	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	77454570
32	NC_007491	CACGC	2	10	2123	2132	20 %	0 %	20 %	60 %	77454570
33	NC_007491	GGT	2	6	2170	2175	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	77454570
34	NC_007491	CG	3	6	2177	2182	0 %	0 %	50 %	50 %	77454570
35	NC_007491	AGC	2	6	2255	2260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	77454570
36	NC_007491	GTCGA	2	10	2307	2316	20 %	20 %	40 %	20 %	77454570
37	NC_007491	CG	3	6	2342	2347	0 %	0 %	50 %	50 %	77454570
38	NC_007491	ACC	2	6	2434	2439	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	77454570
39	NC_007491	GCC	2	6	2451	2456	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	77454570
40	NC_007491	CGC	2	6	2657	2662	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
41	NC_007491	AGA	2	6	2709	2714	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_007491	TGAG	2	8	2725	2732	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_007491	ACC	2	6	2762	2767	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	77454571
44	NC_007491	TCT	2	6	2863	2868	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	77454571
45	NC_007491	CCG	2	6	2883	2888	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	77454571
46	NC_007491	TTC	2	6	2942	2947	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	77454571
47	NC_007491	TGA	3	9	2962	2970	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	77454571
48	NC_007491	TCG	2	6	2979	2984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	77454571
49	NC_007491	TGG	2	6	2987	2992	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	77454571
50	NC_007491	CGA	2	6	3064	3069	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	77454571
51	NC_007491	ACC	2	6	3071	3076	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	77454571
52	NC_007491	CGT	2	6	3112	3117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	77454571
53	NC_007491	CGC	2	6	3178	3183	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	77454571
54	NC_007491	GGC	2	6	3262	3267	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	77454571
55	NC_007491	TGG	2	6	3303	3308	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	77454571
56	NC_007491	GGA	2	6	3346	3351	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	77454571
57	NC_007491	ACG	2	6	3504	3509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	77454571
58	NC_007491	TGA	2	6	3520	3525	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	77454571
59	NC_007491	ATT	2	6	3572	3577	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	77454571
60	NC_007491	GAG	2	6	3578	3583	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	77454571
61	NC_007491	GAA	2	6	3641	3646	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	77454571
62	NC_007491	AGG	2	6	3658	3663	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	77454571
63	NC_007491	GGCAAT	2	12	3835	3846	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	77454571
64	NC_007491	GTG	2	6	3937	3942	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	77454571
65	NC_007491	GCC	2	6	3959	3964	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	77454571
66	NC_007491	GTGG	2	8	4000	4007	0 %	25 %	75 %	0 %	77454571
67	NC_007491	GCTGG	2	10	4070	4079	0 %	20 %	60 %	20 %	77454571
68	NC_007491	CGG	2	6	4080	4085	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	77454571
69	NC_007491	GCA	2	6	4099	4104	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	77454571
70	NC_007491	ACT	2	6	4114	4119	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	77454571
71	NC_007491	GAG	2	6	4196	4201	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	77454571
72	NC_007491	CGA	2	6	4366	4371	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	77454571
73	NC_007491	G	6	6	4409	4414	0 %	0 %	100 %	0 %	77454571
74	NC_007491	TCC	2	6	4455	4460	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	77454571
75	NC_007491	CAC	2	6	4597	4602	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	77454571
76	NC_007491	TGA	2	6	4612	4617	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	77454571
77	NC_007491	CG	3	6	4636	4641	0 %	0 %	50 %	50 %	77454571
78	NC_007491	GA	3	6	4722	4727	50 %	0 %	50 %	0 %	77454571
79	NC_007491	AAC	2	6	4833	4838	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	77454571
80	NC_007491	TG	3	6	4933	4938	0 %	50 %	50 %	0 %	77454571
81	NC_007491	CGC	2	6	5061	5066	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	77454571
82	NC_007491	CCG	2	6	5087	5092	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	77454571
83	NC_007491	TTC	2	6	5105	5110	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	77454571
84	NC_007491	GAA	2	6	5180	5185	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	77454571
85	NC_007491	GCG	2	6	5225	5230	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	77454571
86	NC_007491	GTT	2	6	5237	5242	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	77454571
87	NC_007491	GC	3	6	5311	5316	0 %	0 %	50 %	50 %	77454571
88	NC_007491	AAC	2	6	5341	5346	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	77454571
89	NC_007491	TC	3	6	5392	5397	0 %	50 %	0 %	50 %	77454571
90	NC_007491	TGG	2	6	5412	5417	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	77454571
91	NC_007491	TCA	2	6	5444	5449	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	77454571
92	NC_007491	GGT	2	6	5473	5478	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	77454571
93	NC_007491	CGA	2	6	5513	5518	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	77454571
94	NC_007491	GCC	2	6	5688	5693	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	77454572
95	NC_007491	CGG	2	6	5718	5723	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	77454572
96	NC_007491	GCG	3	9	5787	5795	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	77454572
97	NC_007491	GAA	2	6	5861	5866	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	77454572
98	NC_007491	ATC	2	6	5900	5905	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	77454572
99	NC_007491	TGA	2	6	5944	5949	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	77454572
100	NC_007491	GTG	2	6	5952	5957	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	77454572
101	NC_007491	GCC	2	6	5991	5996	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	77454572
102	NC_007491	GGT	2	6	6049	6054	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	77454572
103	NC_007491	ACG	2	6	6189	6194	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	77454572
104	NC_007491	CCG	2	6	6204	6209	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	77454572
105	NC_007491	GCCG	2	8	6229	6236	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
106	NC_007491	CCTG	2	8	6245	6252	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
107	NC_007491	CTG	2	6	6305	6310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_007491	TTCATG	2	12	6317	6328	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
109	NC_007491	TC	3	6	6353	6358	0 %	50 %	0 %	50 %	77454573
110	NC_007491	CCT	2	6	6465	6470	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	77454573
111	NC_007491	ACA	2	6	6491	6496	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	77454573
112	NC_007491	CGT	2	6	6517	6522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	77454573
113	NC_007491	CGG	2	6	6545	6550	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	77454573
114	NC_007491	ACCG	2	8	6560	6567	25 %	0 %	25 %	50 %	77454573
115	NC_007491	TGA	2	6	6582	6587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	77454573
116	NC_007491	GCC	2	6	6594	6599	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	77454573
117	NC_007491	CACGC	2	10	6657	6666	20 %	0 %	20 %	60 %	77454573
118	NC_007491	TTG	2	6	6730	6735	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	77454573
119	NC_007491	CGC	2	6	6799	6804	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	77454573
120	NC_007491	CGA	2	6	6870	6875	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	77454573
121	NC_007491	CAT	2	6	6925	6930	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	77454573
122	NC_007491	TCGC	2	8	6975	6982	0 %	25 %	25 %	50 %	77454573
123	NC_007491	GCC	2	6	7025	7030	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	77454574
124	NC_007491	CG	3	6	7150	7155	0 %	0 %	50 %	50 %	77454574
125	NC_007491	GATCTT	2	12	7190	7201	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	77454574
126	NC_007491	GCT	2	6	7235	7240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	77454574
127	NC_007491	CTT	2	6	7258	7263	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	77454574
128	NC_007491	AGCC	2	8	7361	7368	25 %	0 %	25 %	50 %	77454574
129	NC_007491	CAG	2	6	7457	7462	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	77454574
130	NC_007491	GCCG	2	8	7513	7520	0 %	0 %	50 %	50 %	77454574
131	NC_007491	GAA	2	6	7532	7537	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	77454574
132	NC_007491	C	6	6	7561	7566	0 %	0 %	0 %	100 %	77454574
133	NC_007491	GCT	2	6	7611	7616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	77454574
134	NC_007491	CGGC	2	8	7632	7639	0 %	0 %	50 %	50 %	77454574
135	NC_007491	ACG	2	6	7684	7689	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_007491	TTCG	2	8	7747	7754	0 %	50 %	25 %	25 %	77454575
137	NC_007491	GGT	2	6	7806	7811	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	77454575
138	NC_007491	TCG	2	6	7904	7909	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	77454575
139	NC_007491	ATG	2	6	7988	7993	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	77454575
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141	NC_007491	TGG	2	6	8018	8023	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	77454575
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143	NC_007491	GCT	2	6	8348	8353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	77454575
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162	NC_007491	CGG	2	6	9238	9243	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	77454575
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259	NC_007491	CGGAG	2	10	13705	13714	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
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261	NC_007491	TGG	2	6	13769	13774	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
262	NC_007491	G	6	6	13780	13785	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
263	NC_007491	CAG	2	6	13798	13803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
264	NC_007491	GCC	2	6	13948	13953	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
265	NC_007491	CAG	2	6	13979	13984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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267	NC_007491	CAC	2	6	14027	14032	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	77454577
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398	NC_007491	GCT	2	6	20525	20530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	77454582
399	NC_007491	CGG	2	6	20543	20548	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	77454582
400	NC_007491	GAT	2	6	20562	20567	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	77454582
401	NC_007491	CGA	2	6	20579	20584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	77454582
402	NC_007491	CGA	2	6	20588	20593	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	77454582
403	NC_007491	ATC	2	6	20632	20637	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	77454582
404	NC_007491	TGC	2	6	20649	20654	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	77454582
405	NC_007491	AGTCC	2	10	20663	20672	20 %	20 %	20 %	40 %	77454582
406	NC_007491	TGT	2	6	20819	20824	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	77454582
407	NC_007491	GATC	2	8	20864	20871	25 %	25 %	25 %	25 %	77454582
408	NC_007491	TGA	2	6	20885	20890	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	77454582
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410	NC_007491	CGG	2	6	21038	21043	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	77454582
411	NC_007491	CGA	2	6	21083	21088	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	77454582
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413	NC_007491	CGG	2	6	21146	21151	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	77454582
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423	NC_007491	TTG	2	6	21805	21810	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	77454582
424	NC_007491	CTG	2	6	21861	21866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	77454582
425	NC_007491	CTTG	2	8	21884	21891	0 %	50 %	25 %	25 %	77454582
426	NC_007491	GAA	2	6	21910	21915	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	77454582
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428	NC_007491	ACC	2	6	21955	21960	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	77454582
429	NC_007491	GCT	2	6	22042	22047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	77454582
430	NC_007491	AAG	2	6	22050	22055	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	77454582
431	NC_007491	GCC	2	6	22057	22062	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	77454582
432	NC_007491	GTC	2	6	22111	22116	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	77454582
433	NC_007491	CGA	2	6	22207	22212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	77454583
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442	NC_007491	TCCGT	2	10	22633	22642	0 %	40 %	20 %	40 %	77454584
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444	NC_007491	AG	3	6	22785	22790	50 %	0 %	50 %	0 %	77454584
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449	NC_007491	TGG	2	6	22982	22987	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	77454584
450	NC_007491	CAG	2	6	23002	23007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	77454584
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453	NC_007491	GAC	2	6	23198	23203	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	77454584
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456	NC_007491	AGC	2	6	23289	23294	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
457	NC_007491	TGTT	2	8	23317	23324	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
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462	NC_007491	A	6	6	23467	23472	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
463	NC_007491	AGG	2	6	23568	23573	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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465	NC_007491	CGA	2	6	23680	23685	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	77454585
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468	NC_007491	ACTCG	2	10	23791	23800	20 %	20 %	20 %	40 %	77454585
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480	NC_007491	TCG	2	6	24064	24069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	77454586
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489	NC_007491	CTTC	2	8	24427	24434	0 %	50 %	0 %	50 %	77454586
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495	NC_007491	CGG	2	6	24783	24788	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	77454586
496	NC_007491	CGC	2	6	24818	24823	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	77454586
497	NC_007491	CTC	2	6	24839	24844	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	77454586
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